Подобно системе септика "ТОПАС", устройства СБО "Топас-С" оперируют на основе аэробной биологической очистки сточных вод. Важно отметить, что этот процесс разбит на четыре ключевых камеры, включая приемную камеру, аэротенк, вторичный отстойник и стабилизатор ила. Вода перемещается между этими камерами, при этом используются как естественные процессы, так и специальные насосы, называемые эрлифтами, для перемещения стоков. Эти устройства не только обеспечивают передвижение воды, но и насыщают ее кислородом с помощью аэраторов, обеспечивая тем самым жизнедеятельность бактерий, отвечающих за очистку.
Для активации аэраторов и эрлифтов требуется сжатый воздух, который подается из компрессора или компрессоров.